Ook het spoor kan gewijzigd worden. Bij railverkeer hoeft het echter niet om fysieke wijzigingen aan het spoor te gaan maar kan het ook gaan om een toename van het treinverkeer. De gevallen waarin een saneringssituatie samenvalt met een ‘wijziging van een spoorweg’ worden ‘gekoppelde sanering’ genoemd.

Bij gekoppelde sanering ligt het initiatief voor het opstellen van een saneringsprogramma bij de spoorwegexploitant (ProRail). BSV stelt vervolgens voor de saneringssituaties de ten hoogste toelaatbare waarde van de geluidsbelasting na sanering en na wijziging van de spoorweg vast. Ook voor de overige geluidsgevoelige bestemmingen (niet sanering) met een geluidbelasting boven de streefwaarde van 55 dB waar de toename niet wordt weggenomen stelt BSV wordt ten hoogste toelaatbare waarde vast. Voor de maatregelen is subsidie mogelijk voor het deel dat nodig is om de sanering op te heffen. De maatregelen die nodig zijn om de toename van de geluidbelasting door de wijzigingen aan de weg te nemen, komen ten laste van de ProRail.

Rail21-lijst
Daarnaast is een lijst met spoortrajecten opgesteld waar ProRail gepland heeft werkzaamheden te verrichten, de zogeheten Rail21-lijst. Afgesproken is dat ProRail de sanering in die gevallen ook betaald. De afspraken zijn vastgelegd in de “Nadere afspraken geluidsanering bij spoorwerkzaamheden”. De betreffende lijst wordt periodiek geactualiseerd. De laatste actualisatie is van 21 april 2010.